I moderni metodi di analisi in genomica, trascrittomica, proteomica e metabolomica generano grandi quantità di dati complessi. L’obiettivo del gruppo di lavoro MultiOmics Data Science è supportare nell’analisi, nell’integrazione e nell’interpretazione di questi dati. Integrando diversi livelli omici è possibile comprendere in modo più completo i processi biologici e ottenere nuove conoscenze per l’agricoltura, la qualità degli alimenti e la salute. In questo contesto collaboriamo strettamente con il MultiOmics Centre for Food and Health (MOC).

Nel laboratorio presso il NOI Techpark possiamo effettuare internamente sequenziamenti long-read mediante tecnologia Nanopore, affrontando così quesiti nell’ambito della genomica e della trascrittomica. La successiva analisi dei dati viene eseguita sulla nostra workstation; per analisi particolarmente impegnative dal punto di vista computazionale utilizziamo inoltre le capacità di calcolo del cluster HPC nell’ambito del MultiOmics Centre for Food and Health (MOC). In questo modo uniamo lavoro di laboratorio, bioinformatica e integrazione dei dati in workflow riproducibili e risultati orientati alla pratica.

Esempi del nostro lavoro:

• Analisi dei cambiamenti epigenetici nelle foglie colpite dagli scopazzi del melo, per comprendere meglio come si sviluppano i sintomi della malattia.
• Creazione di una banca dati dei composti organici volatili (VOC) per identificare meglio le sostanze aromatiche in diversi alimenti e piante mediante spettrometria di massa accoppiata alla gascromatografia (GC-MS).